五百年前，真假美猴王之争实为如来与六耳猕猴的阴谋，孙悟空被害转世为孙家村少年孙小空。马匪屠村后，他与妹妹相依为命。唐僧寻来为其戴上金箍，却因尘缘未了无法唤醒其修为。六耳猕猴暗中布局追杀，欲逼其自毁以继承全部修为。妹妹为成全哥哥自尽，孙小空痛觉醒悟，重归齐天大圣真身。唐僧调停殒命，六耳幡然醒悟，二人共上灵山讨伐如来。激战中八戒等人牺牲，六耳献祭助孙悟空修为大增。如来启动万佛大阵，菩提祖师现身相救。玉帝调停，如来堕入轮回，孙悟空亦自愿转世，愿来世三界清净无争。